MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 plasmid p1HPAKL86

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019564	G	6	6	2	7	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019564	G	6	6	12	17	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019564	AT	3	6	51	56	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019564	A	6	6	452	457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019564	A	6	6	476	481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019564	A	7	7	496	502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019564	TTC	2	6	710	715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019564	GAAT	2	8	729	736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019564	TCA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019564	ATT	2	6	805	810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019564	A	8	8	851	858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019564	AGCG	2	8	964	971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019564	TTTG	2	8	1002	1009	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019564	CAA	2	6	1023	1028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019564	CTT	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019564	CTT	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019564	CTT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019564	CTT	2	6	1408	1413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019564	A	6	6	1426	1431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019564	T	6	6	1439	1444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019564	ATA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019564	CAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019564	ATA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019564	GTGG	2	8	1648	1655	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019564	AGG	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019564	TAG	2	6	1693	1698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019564	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019564	TTA	2	6	1798	1803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019564	AC	3	6	3482	3487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019564	AAG	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019564	TTA	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019564	TTG	2	6	4628	4633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019564	CAA	2	6	4648	4653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019564	CT	3	6	4672	4677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019564	TC	3	6	4720	4725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019564	A	6	6	4739	4744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019564	A	6	6	4778	4783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019564	A	9	9	4806	4814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019564	A	6	6	4824	4829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019564	T	6	6	4929	4934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019564	T	6	6	4943	4948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019564	AAATG	2	10	5002	5011	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019564	ACT	2	6	7265	7270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019564	AAAG	2	8	7307	7314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019564	A	7	7	7337	7343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019564	A	6	6	7358	7363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019564	AGT	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019564	A	6	6	7559	7564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019564	ATA	2	6	9345	9350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019564	ATTT	2	8	9359	9366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019564	TAT	2	6	9370	9375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019564	TGT	2	6	9393	9398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019564	AATTAA	2	12	9419	9430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019564	GTT	2	6	9659	9664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019564	TTG	2	6	9684	9689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019564	GTA	2	6	9732	9737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019564	AAT	2	6	9738	9743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.